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尽管通过调整计划精简内容的形式，LH计划成功在1991年4月进入正式的工程研发阶段。然而世界局势的变化再次迎来剧变：1991年7月1日，华沙公约组织正式宣告解散。同年12月25日，苏联总统戈尔巴乔夫宣布辞职，次日，苏联最高苏维埃通过最后一项决议，宣告苏维埃社会主义共和国联盟不复存在。
一夜之间，冷战的一极不复存在。
在后冷战时代飘摇的科曼奇
在后冷战时代飘摇的科曼奇
这对于普通民众来说当然意味着冷战结束这一好消息。但是对于各个军事装备研发计划而言却意味着新的变故来临。削减国防开支，重新调整国家资源分配将无可避免。
1992年的新年度预算编列时，国防部长切尼宣布，五角大楼会继续为新一代武器发展计划拨款。但仅确保支持发展，不保证一定会投入量产。而项目前景相当不乐观的A-12项目则早在1991年1月便宣告取消。
RAH-66研发计划随即进行了第三次重大调整。新政策将更加强调对关键部件的验证。如航电、T800涡轴发动机和“长弓（Long Bow）”毫米波雷达。原型测试阶段再次延长，结束年份从1995年延长至1997年。而原型机数量从从4架减少到3架，原型机首飞时间延后到1995年8月。国防部随后批准了陆军调整后的采购策略，授权采购3架原型机搭配完全形态的T800-801发动机进行飞行测试。同时进行机炮系统的额外测试。至此，整个Dem/Val阶段从52个月大幅延长至78个月，接下来的工程制造开发（Engineering and Manufacturuing Development EMD）阶段（即原本的FSD阶段）则未获得授权。
由国防部主导的第三次计划调整通过延长原型测试时间的方式延后了费用高昂的全面工程开发与量产阶段费用，但是代价便是计划的研发测试费用因此疯涨了14亿美元。
1993年1月，美国领导层由老布什政府正式过渡到了克林顿政府。而对于在开发中的多个装备研发项目而言，在选举中主张改善经济、平衡财政的克林顿政府上台并非是什么好消息。国防预算显然会是新政府首先动刀的项目。
1993年2月针对科曼奇项目EMD阶段的经费需求审查表明，整个计划有至少4.24亿美元的经费缺口，而在稍后3月的计划预算决策中，国防部又削减了RAH-66项目1994财年7600万美元预定经费。 如果加上预定在1995财年削减的1900万元经费。RAH-66项目仅在的Dem/Val阶段已经有了9500万美元的经费缺口。
为此，RAH-66项目在1993年9月的会议中决定再次重组计划，相应的延后了原定1994年与1995年进行的测试工作，并删除了在Dem/Val阶段进行“长弓”雷达的整合的要求。通过这些延后和内容削减，有望在1994财年省出6500万美元的开支。1993年3月，五角大楼发布了《全面防务审查报告》，全面评估了美军各军种准则、部队结构和现代化计划。并基本确定了美军在冷战后的规模和基本结构。
报告同样提到了RAH-66项目，认为该项目在技术与成本方面都面临相当高风险，建议仔细监督整个项目进行。不过也确认了RAH-66对于改善陆军战场情报获取能力的价值。而RAH-66开发计划在1994年争取到额外500万美元经费后，美国陆军线西科斯基和波音发出了新的指示：停止发展3号原型机。为长弓雷达发展提供有限支援，以确保长弓雷达系统能最终整合到RAH-66上。在1994年，RAH-66项目引入了所谓“流线型（streamline）”的新策略，即设法合并Dem/Val阶段与EMD阶段的部分工作从而达到减少开支并加快进度的目的。
经历连续的计划调整后，RAH-66终于在1993年12月通过关键设计评审，开始了原型机建造工作。而原型机的部件则在之前的9月便开始了建造过程。与此同时，发动机试车、旋翼系统测试也同步展开。
尽管动力系统测试中发生共振导致测试出现意外，但是RAH-66在原型机阶段整体进展颇为顺利。尤其是重量控制通过对于功能的取舍和工程方面的努力，已经得到了接近圆满的解决，关键评审阶段时超重已经不足20磅，尽管后来结构设计的细化让机体重量有所增加，但是没有超出美国陆军制定的200磅上限。看上去整个计划将会顺利完成。
然而新的麻烦不期而至，此时正在到处找项目开刀缩减军费的克林顿政府自然而然又找上了陆军列为最优先项目、耗资不菲的RAH-66项目。1994年8月，美国陆军接到了国防部副部长的指示，要求拟定科曼奇计划取消时的替代方案。而克林顿政府刚刚在之前的五年国防计划（Five-Year Defense Plan）中对陆军的直升机项目进行了大杀特杀：AH-64在1994财年采购的10架全新机体于1996年完工后就将停止采购，CH-47则在1992财年采购两架用于补充海湾战争损失的新机后也停止采购。甚至还处于量产阶段的UH-60也计划在1996年停产。
这意味着如果科曼奇计划一旦被砍，美国直升机业除了海外用户订单外将基本没有机会再生产全新的军用直升机，这对于美国直升机产业将真正意味着冬天来临。为此副助理陆军部长在1994年的一次会谈中便极力强调陆军预算已经遭到连年削减，要求在1996财年增加6亿美元预算以满足陆军基本的军备现代化所需。稍后的10月份，助理国防部长指示陆军尽快以之前的“流线化”策略推进科曼奇项目。
不过，就在陆军正式实施前，时任国防部长莱斯·阿斯平（Leslie Aspin）因个人健康问题和索马里“黑鹰坠落”事件宣布离职，威廉·佩里（William Perry）在1994年2月3日出任新一任的国防部长。
佩里上任后，在1994年12月9日指示美国陆军再次重组RAH-66研发计划。而这次重组本质上是国防部的大型防务装备计划删减与重组的一环，很有可能导致科曼奇计划停止量产。
美国陆军在这次大规模调整中面临了一个二选一的局面，即到底是保留科曼奇计划还是保留同期进行的另一高优先级项目：先进野战炮兵系统（Advanced Field Artillery System），即“十字军（Crusader）”自行火炮。考虑到替换老旧的M109火炮的需求更为迫切，最终陆军选择了优先确保“十字军”火炮项目。
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点击查看美国国防部在1995年12月发布的一份备忘录中，指示将“科曼奇”项目改组为一个工业与技术验证计划，其量产将被无限期推迟。
为了挽救科曼奇项目，包括陆军参谋长戈登•沙利文（Gordon Sullivan）、首席助理陆军部长吉尔伯特•德克尔（Gilbert Decker）在内的一干美军陆军高层和负责科曼奇项目的计划经理在西雅图会谈后就决定先设法维持科曼奇项目的研发与测试，等到预算情况好转再考虑投入量产。 并以此为制导制定了新的发展计划梗概。整个项目将进行政治目的浓厚的第四次重组。
第四次重组
第四次重组
新计划称为“早期作战能力（Early Operational Caoability EOC）”计划。考虑到整个科曼奇（LHX/LH）项目已经花掉10亿美元和12年时间，而决策者和公众能看到的不过几个全尺寸模型。为了让决策者和公众认识到钱花得物有所值，EOC计划的目的就是尽快推出具备一定作战能力的机体：其功能上会比正式的量产机有所折扣，但是具备投入量产服役的能力。这样以便于让决策者和陆军其他高层能认识到这一项目的价值，从而为科曼奇项目争取经费。
因此，第四次计划重组大费周章的引进了所谓“早期作战能力”概念，因此不仅要求进行原型测试，还要求在2001年前另外交付6架EOC机体进行测试与评估使用。6架EOC机体并非正式量产型。这些机体不包含武器系统，任务装备套件（MEP）也不包含先进瞄准系统，但是相比另外2架Dem/Val原型机会更为完整。简而言之，就是在Dem/Val原型机和正式量产机之间的“过渡形态”。 这样的过渡形态已经能部分展示与验证RAH-66的飞行与侦察能力，并能有效加速RAH-66的整个研发进度以减少开支。
美国国防部采购委员会在听取EOC计划简报后，在1995年3月16日批准了EOC计划，助理国防部长在五天后同样核准了新方案，并同时制定了科曼奇项目进入里程碑II审查的标准。
计划重组后，美国陆军与承包商签订了EOC合同，确定将在2001年交付EOC机体。任务装备套件（MEP） 则分两阶段分别发展并整合到机体上：第一阶段重点发展侦察用传感器以用于整合到EOC原型机，安装了侦察用传感器的EOC原型机将在2002开始2年的作战测试。而在2000年到2003左右的第二阶段中再发展武器系统，在2004年将武器系统整合到机体。并在之后2005年到2006年间开始初始作战测试与评估（ITO&E），然后在2006达到初始作战能力（IOC）。
而在1995年5月25日，第一架YRAH-66原型机在西科斯基工厂完工出厂。原型机的飞行测试也随之展开。
一号原型机的早期试飞
一号原型机的早期试飞
序号94-0327的第一架YRAH-66前后两段机身在1995年1月25日在西科斯基所属工厂中组装为了完整机体，并在4个月后的5月25日完成了后续子系统安装作业，正式完工出厂。同年6月，1号原型机被送到了测试中心进行了一连串地面测试，并最终在1996年1月4日进行了36分钟的首飞。
相比之前展示的全尺寸模型，YRAH-66实机更为棱角分明。并且，原型机上首次清楚展现了RAH-66独特的发动机排气结构。而这正是RAH-66的红外信号抑制设计的关键措施：
发动机排出的高温废气通过管道导向尾梁，与背部进气口吸入的冷空气以冷热空气比一比五混合后排出。通过这套排气系统，RAH-66侧面的红外辐射信号强度只有OH-58D的50%，AH-64的25%。
尽管在1996年1月，YRAH-66就进行了首飞，但是直到1996年10月，YRAH-66只进行了7小时飞行。除了经费问题影响外，一部分来自动力系统的技术问题：
YRAH-66使用的T800-LHT-801发动机在之前的推进系统测试平台的110%动力输出测试中由于共振问题出现过齿轮碎裂、碎片击穿主主齿轮箱基座的意外。因此YRAH-66初期试飞限制了发动机输出功率。这七小时的最初试飞中达到的最大飞行速度只有100节。
而且RAH-66的旋翼转速只有200到400转每分，因此传动箱的最终级需要承受极高的扭矩。传动系统的可靠性尚存在疑虑。
一号原型机随后在1997年中换装了改进的减速器，并在同年8月恢复试飞。配合更大范围应用遥测技术，原型机测试进度明显加快。到1997年后期，一号原型机已经积累了62小时的试飞时间。并达到了设计中最大170节飞行速度和45节的向后/侧飞速度。
而涵道尾桨系统在试飞中展现了极高的控制力，传统直升机快速飞行时掉头对准目标需要侧转进入90度转弯——改出——机头对准目标的一系列过程，而YRAH-66只需要简单旋转90度就能直接在侧飞状态将机头对准目标。
而就在一号原型机加快试飞的同时，序号95-0001的2号原型机也在1996年12月初开始了最终组装工作。不过相比一号原型机，组装完成后的二号原型机承担了更多的公关任务。
科曼奇的公关攻势
科曼奇的公关攻势
1998年4月，刚刚组装完成YRAH-66二号原型机还未经过试飞便被运到了北卡罗来纳州最大城市夏洛特（Charlotte），在此地举行的美国陆军航空协会（Army Aviation Association of American AAAA）的年度论坛中进行了公开展示，之后才送往了西科斯基的测试场。但是依旧没有进行首飞，而是远渡重洋参加了1998年9月的范堡罗（Farnborough）航展。这也是YRAH-66第一次在公众面前亮相。
二号机参加完范堡罗航展回到美国后，才在1999年3月30日进行了首飞。紧接着又被送往法国，参加1999年6月的巴黎航展。
除了实机外，RAH-66的模型和模拟器早在1994年底开始，就出现在了每一场主要的防务展出中。甚至著名军事小说家汤姆·克兰西（Tom Clancy）还在波音和西科斯基的邀请下，亲自坐进了模拟器内体验了一把。而汤姆·克兰西本身也相当关注科曼奇计划的发展，早在1994年8月出版的小说《Debt of Honor》中就有RAH-66的出场。
这次体验给汤姆·克兰西留下深刻印象，之后其同意无偿为陆军一部12分钟的科曼奇计划宣传片作旁白，并在多个公众活动中为科曼奇计划代言宣传。
美国陆军和波音-西科斯基如此积极的公关攻势，原因在于科曼奇项目早期能力计划（EOC）的执行不算顺利。
由于国会在之前取消了项目1997财年4000万美元预算，导致波音-西科斯基和美国陆军间的合约谈判陷入僵局，一直拖到1996年底都未能完成合约签订工作。最后为了应对预算削减，双方的妥协方案是将原本预定在EOC原型机上就要安装的多个侦察系统部件延后到低速生产阶段再进行安装测试。最终在1997年1月达成了总额37亿美元的新合同，采用成本附加奖金形式，依照每季度效能审查结果，承包商能获得最高10%额度的奖金。新合同包括2架Dem/Val原型机和6架全新的EOC阶段原型机。EOC原型机的全部交付时间定在了2002年9月前。
除了在工程研发和项目管理方面继续努力外，美国陆军和波音-西科斯基也开始考虑改变公关策略，将原本已对政界为主的游说转为了针对民众的大规模宣传攻势。以此争取更多的政治支持。陆军和承包商的努力获得了一定回报，尽管克林顿政府的陆军现代化计划并未给予科曼奇项目更多支持，但是国会还是伸出了援手。主动将1996财年的科曼奇项目预算从1亿美元增加到了2.99亿美元。
计划的第五次重组
计划的第五次重组
EOC计划框架下，科曼奇计划又渡过了两年。到了1998年，项目相关负责人发现美国陆军内部许多航空相关的官员开始质疑EOC计划的可行性。他们提出的观点主要在于，将EOC版本这样并不能完全达到量产机水平的过渡性质机体交给测试单位进行作战测试，可能让测试单位和外界对科曼奇留下不良印象，进而影响对科曼奇计划的支持。
为此，科曼奇计划在1998年进行了第五次重组。在先前EOC计划相同的预算限制下，以加速任务装备套件和“长弓”雷达等关键子系统的研发进程为目标制定了新计划。新计划称为预生产原型机（Pre-Production Prototype PPP）计划。
PPP计划相比之前EOC计划，将测试机交付时间延后两年。但是需要交付数量从6架增加到了14架。同时，PPP计划将国防采购委员会的里程碑II审查安排在了2000年3月，提前了19个月时间。但达成早期作战能力的时间为此2006财年不变。待通过里程碑II审查进入工程制造发展（EMD）阶段时，将以任务套件发展和“长弓”雷达整合为重点。
因此交付的最初6架作为预生产型将会有4架安装“长弓”雷达，并在2005财年开始进行有限作战测试。而第7到第14的8架作为早期量产型，技术状态接近正式量产机。因此将整合完整的侦查系统和武器系统，以便于参加1400飞行小时的ITO&E测试。同时，PPP计划将原本在投入低速量产后的Lot 6批次才进行整合的“长弓”雷达提前到了Lot 1批次，因此预生产原型机（PPP）将具备接近正式量产机的功能。
助理国防部长随后在1998年7月27日批准了这一计划，科曼奇项目就此完成了整个计划第五次计划重组。
工程制造发展（EMD）阶段
工程制造发展（EMD）阶段
经历12年的Dem/Val阶段，科曼奇项目终于在2000年4月4日通过了里程碑II审查。里程碑II审查了包括：垂直爬升率、传感器侦查距离、雷达截面积（RCS）、弹道损伤以及火控雷达测试七项关键指标，并最终许可科曼奇项目进入工程制造与发展（EMD）阶段。2000年6月1日，波音与西斯科斯与美国陆军签订了价值31亿美元的EMD阶段合同，标志这科曼奇项目正式进入EMD阶段。
合同基本遵照了之前PPP计划的流程，整个EMD阶段将有6年。不过作为EMD原型机的预生产型出于节省经费考虑减少了一架。而用于IOT&E测试的早期量产型则为此8架不变。波音和西科斯基预定从2003年开始生产总数13架测试用机并在2004年进行首架预生产型首飞。而陆军则在2005财年采购Lot 1批次的低速初始生产（LRIP）机，并在2006年达到初始作战能力。随后的2007财年则开始全速生产。总采购量一度考虑减少到1096架，不过最终EMD合同中规定的为1213架，其中412架配备“长弓”雷达。
EMD阶段的RAH-66相比YRAH-66进行了进一步修改：
- 主旋翼直径增加0.3米，并增加了下垂的翼尖结构。
- 水平安定面两端增加一片内倾垂直安定面。
- 机炮增加收纳结构。
- 座舱盖、发动机罩和涵道式尾桨整流罩外形修改。
- 增加了主旋翼桨毂整流罩。
除此之外还包括尾轮前移等一系列细节修改，而动力系统也更换为完全形态的T800-LHT-801。
而为了验证EMD阶段的修改，YRAH-66的1号原型机在2000年进行了一系列外形修改：尾部安装了修改后的尾翼在垂直安定面两侧新增了倾斜布置的垂直安定面，排气口的位置修改到了更低位置，主旋翼桨毂和涵道式尾桨安装了全新的整流罩。而最明显的则是主旋翼桅顶的“长弓”雷达模型。
最终在2000年12月18日完成修改工程，恢复试飞。
至2001年5月结束测试时，一号原型机已经累计了318架次总计387小时的试飞时间。二号YRAH-66主要承担任务设备套件的试飞测试，到2001年5月也累积了93架次103小时的试飞时间。接下来二号原型机更换了性能更强的完全形态T800-LHT-801发动机，然后在2002年5月23日恢复了试飞，并同步开始了夜视系统与武器系统的测试。而一号原型机则转入预定的结构负荷试验。
根据美国陆军的要求，RAH-66应该达到在不安装长弓雷达的形态下达到175节的最大平飞速度和165节的巡航速度，垂直爬升率273米每分（安装长弓雷达形态的三个数据分别是166节、149节和152米每分种）。侧飞与向后飞行则都应达到80节，悬停和转弯相关的要求则是在80节航速下以4.5秒将机头指向目标或4.7秒悬停回转180度将机头朝向目标。而进入悬停掩蔽姿势的时间则要在1.6秒内。
而YRAH-66原型机在测试中达到了最大平飞速度175节、巡航速度162节的成绩，垂直爬升率更是达到了432米每分（不过此时为轻载状态）。尽管向左侧飞和向右侧飞分别只有75节和64节，但是180度回旋时间控制在了5秒以内且滚转率达到了100度/秒。
理论上只要在之后完成EMD原型机建造和测试，科曼奇项目就离进入正式量产不远了。但是世界局势变化再次和科曼奇项目开了个大玩笑。
“反恐战争”时代的冲击
“反恐战争”时代的冲击
2001年9月11日上午，两架被恐怖分子劫持的民航客机分别撞向美国纽约世界贸易中心一号楼和世界贸易中心二号楼，两座建筑在遭到攻击后相继倒塌。这便是震惊世界的9·11事件。
事件发生后，布什政府认定“基地”组织本·拉登是恐怖袭击事件头号嫌犯，并随后在2001年发动“反恐战争”入侵阿富汗以消灭藏匿基地组织的阿富汗塔利班政权。自此，美国的国防力量重心全面转向全球反恐行动。
随后在2003年3月20日，布什政府又以伊拉克萨达姆政权藏有大规模杀伤性武器和支持和恐怖分子为理由发动了入侵伊拉克的战争。
内容因剧透、敏感不适等原因被隐藏
点击查看阿富汗和伊拉克的正面战场交战很快以一边倒的结果落幕，但是随后美军在两地陷入了无止境的治安战。两地强度不高、技术水平更是有限的战事却如同黑洞般吞没了美军大量人力物力，而消耗的资金更是影响到了美军多个新装备的开发。
诸如F-22战斗机、“十字军”自行火炮等冷战遗留项目的投资都在这一时期受到了严重削减，以为反游击战装备采购项目划出资金。科曼奇项目一样深受其害。作为为高强度的全面对抗环境而设计的项目，RAH-66诸如低可探测性、飞行机动性等特征在低强度的反游击队战中都派不上用场，因此经费不可避免受到削减。
而另一方面，科曼奇项目在技术上的必要性也受到了严重质疑。
单就RAH-66搭载的航电系统和传感器而言，在20世纪80年代到90年代初确实是尖端水平，如头盔显示器、全玻璃化驾驶舱等技术在当时都是首创的新技术。然而由于受到各种因素影响，原定90年代末期就应该加入现役的RAH-66直到21世纪初依旧还在开发阶段。航电系统等采用的电子部件由于设计早已冻结，因此极其遗憾的错过了90年代末开始的IT技术和通信技术革命。由于技术的飞速发展，21世纪初期的电子技术已经能以更低成本实现RAH-66所采用技术相同性能。
如果说部件技术方面的落后还能通过之后持续的技术升级来弥补的话，其在战场上职能受到新技术相当程度替代就是难以忽视的问题了。
在LHX计划刚刚启动的上世纪80年代中后期，无人机（Unmanned Aerial Vehicle UAV）只是起到了辅助作用。但是到了21世纪初，无人机却在反恐战争中大放异彩，相当程度替代了原本将由RAH-66扮演的角色。
相比有人驾驶的武装侦察直升机，典型的中型无人机型号巡航速度要略低。且由于操控依赖数据链从远程遥控进行，现场的随机应变能力和反应速度显然要低得多。但是无人机却拥有其难以替代的优势：
即使MQ-1这样的中型无人机都拥有10小时甚至20小时以上的滞空时间，而相比之下RAH-66的设计最长续航时间只有2.5小时。而由于电子技术的进步，起飞重量1000KG左右的中型无人机就能携带精密的全天候传感器和相应的目标指示系统。部分机型甚至能装备RAH-66都没有配备的合成孔径雷达。而体积更小的中型无人机在整合隐身技术方面拥有天然优势，足以抵消RAH-66的低信号特征优势。而随着无人机察打一体概念的逐渐成熟，武装化的无人机能够配备包括制导炸弹、空对地导弹甚至空对空导弹执行原本由侦察攻击直升机执行的部分攻击任务。
因此，无人机可以以更低的成本来满足原先由侦察直升机完成的战场侦察、监视任务且风险也更低。尽管这并非意味着无人机能够完全替代有人驾驶的武装侦察直升机，但是有人驾驶侦察直升机的需求确实确实大幅降低了。科曼奇项目上千架的采购规模变得不合时宜起来。
尽管美国陆军还是希望保留科曼奇项目以应对之后高强度作战的可能性，但是科曼奇计划的再次重组已经不可避免。
2002年中，美国陆军对科曼奇项目进行了第六次重组，随后美国国防部负责装备需求的助理部长签署了备忘录正式批准了陆军的科曼奇项目重组计划。
第六次项目重组
第六次项目重组
这次重组大幅削减了RAH-66的采购数量，从EMD合同的1213架砍到了650架，其中73架为不同Lot批次的低速初始生产（LRIP）机，其余577架为全速量产机。以每年60架的速度维持持续量产到2019年（如经费允许则希望提速到96架每年）。而EMD阶段的测试用机则从13架减少到9架。
根据新计划。承包商从2005财年开始交付4架发展测试用机，稍后则交付用于训练的5架机体。9架测试用机将用于飞行测试、任务组件整合等一系列测试。陆军暂定在2007年初进行里程碑III审查，从而确认是否让科曼奇项目进入LRIP量产阶段。如一切顺利，陆军将在2008年后期开始接受最初16架LRIP量产机以组成第一个RAH-66中队。
而为了降低技术开发难度，包括部分LRIP型在内的量产机将划分为五个批次，各种子设备和附加的能力要求将分批次加入：
- Block 1：第12号机到89号机。包括了LRIP型的Lot1到lot3批次。具备大部分主要探测、通讯组件于武器系统。并具备基本的Level 2级无人机控制能力。“长弓”雷达仅列入目标配置。2009年开始交付；
- Block 2：90号机到209号机。全速率量产型（Full Rate Production FRP）。“长弓”雷达列为基本门槛装备，增加Level 4的无人机控制能力和Link16数据链。2011年开始交付；
- Block 3：210号机及以后。增强武装侦察型（Enhanced Armed Recon）。增加用于携带外挂装备的可拆卸式短翼、战术专家辅助功能、传感器融合能力。2013年开始交付；
- Block 4/5：改进目标部队型(Improved Objective Froce)/目标部队升级型（Objective Froce Upgrade）。增设宽频广域网络等通信系统、改进维护性与可靠性、改用改良型旋翼、采用升级的T800-LHT-802发动机。2018年/2023年开始交付。
通过削减采购数量，有望将科曼奇项目量产阶段费用从393亿削减到269亿。但是单价也将攀升33%达到3230万美元，如果算上分摊的研发成本费用，单价将达到5890万美元（最初LHX规划5023架采购量时期，分摊研发费用后的单价为1210万）。而形成初始作战能力时间也延后到2009年9月。
国防部最终不但同意了这一计划调整，还为总值32亿美元的EMD阶段追加了额外37亿美元，并将EMD阶段延长9个月以便于承包商有更多时间解决技术问题。
通过计划调整，国防部暂时允许了科曼奇计划继续进行，不过陆军明显对650架的采购规模不满。陆军相关人士多次声称需要至少819架RAH-66才能满足当时提出的“目标部队（Objective Force）”规划的需求，并希望在2008年就投入服役。尽管冷战时期不乏在陆军强烈要求下，改变了国防部原本规划的案例（如UH-60原定采购量只有1100架，最终却已经累计购买了2500架以上）。
但是冷战早已结束，陆军的军种地位早不如前，这样的单方面要求很难指望得到什么正面回应。而同期正在进行EMD阶段发展的RAH-66也正在面临其工程发展正式开始以来最严重的技术障碍。
最终阶段的技术困难
最终阶段的技术困难
科曼奇项目在这一阶段面临的最为要命的问题是军用航空器研发中常见且致命的技术难题：超重。
随着设计深入，各种装备安装与规格细节修改，RAH-66的空重不断上升。进入EMD阶段前后的2000年，RAH-66前后空重已经达到了8800磅（3992kg），正式进入EMD阶段后的设计空重更是一口气达到了9500磅（4310kg），分别较1992年制定的7765磅规格超出13%和22%。美国陆军要求设计团队进行减重，但是最终也只是在2000年后期将设计空重控制到了9300磅（4218kg）。而到了第六次计划重组前夕的2002年3月，由于事先估计不足与美国陆军之后提出的额外功能要求，科曼奇的空重已经比计划允许的最大重量还要超出近300磅。
超重问题已经影响了该机关键的152米每分的爬升率数据。考虑这一指标是直升机回避攻击的关键性能，美国陆军不得不考虑引进功率进一步提升的T800-LHT-802发动机。不过即便如此，依旧需要将空重控制到9948磅（5371kg）以下才能达到要求的性能，而带来的航程问题更是难以消除。
针对超重这一主要问题，美国陆军开始探讨一系列减重措施。除了从旋翼、机身和其他任务部件中减重外，甚至考虑调整作战需求文件中的规定以在重量方面获得更大余度：
- 将长弓雷达排除在标准载荷之外，
- 降低自主部署航程规格
- 从标准武器挂载中减掉2枚AGM-114导弹。
美国陆军一度希望大幅升级科曼奇项目，以发展一种“重型版本”的科曼奇在未来取代AH-64机队。这可以作为陆军转型计划的一部分。然而AH-64D作为一种成熟平台的改进型号，已经开始了大规模采购与部署，而RAH-66却连基本的研发任务都没有完成。何况RAH-66通过可拆卸式短翼携带更多武器执行重型攻击任务时并不能保持之前的隐身优势，而且在重载模式下的航程远不如AH-64：带长弓雷达的RAH-66即使是只携带用于转场飞行的4油箱配置（2内部副油箱+2外挂油箱），最大航程也只有1581km。相比同样4油箱最长航程1561km的AH-64D并无明显优势，以RAH-66替代AH-64的任务除了远远背离了之前LHX计划的初衷，更是完全不经济的选择。
而科曼奇项目本身的发展中，超重问题已经到了失控的程度：几乎没有人能确信科曼奇项目最终的重量会达到什么程度。甚至为科曼奇配备的发动机功率已经被怀疑难以满足该机在全装备重量下的飞行任务了。而美国陆军试图引进更大功率新发动机的方案显然会导致成本进一步升高和交付时间再次延后。
除了超重问题，科曼奇项目在同期也在面临软件发展问题。这问题一方面是由于各个子系统平行开发缺乏重心的混乱导致的。可以通过调整开发与部署流程，将部分功能（如机炮的完整对空能力、Link 16数据链）延后到后续批次逐步引入就能缓解。而另一方面则是因为RAH-66的软件系统规模庞大且复杂。必须改进软件开发的管理结构与流程。
而为研发复杂性雪上加霜的则是陆军在第六次计划重组中，为科曼奇计划增加了与无人机协同作战的要求。在美国陆军当时探讨中的目标部队（Objective Force）规划中，希望为旅级作战单位配备一支由12架RAH-66和8架UAV构成的侦察监视分队。
为此，陆军决定舍弃为RAH-66引进更先进传感器项目。估计将在2004财年到2009财年，为科曼奇的UAV相关功能投入6.44亿美元的经费。而引入无人机相关能力势必会增加本就不简单的系统开发的复杂性。
不再需要的科曼奇
不再需要的科曼奇
尽管第六次技术调整暂时让科曼奇项目维持了继续开发。但是科曼奇项目本身面临的质疑并没有在这次重组中得到解决。批评者认为RAH-66这样高度精密、低可探测性的直升机已经不适应当前的作战需求。而且由于AH-64D等机型的发展，RAH-66的角色与功能已经有了相当程度的重叠。
至于RAH-66具备的隐身性能也有相当批评者认为只是让该机的生存性相比现有机型稍有改善。尽管科曼奇项目同时在雷达、红外、噪音和目视四个方面进行了低可探测性设计。但是雷达信号方面的降低最为显著，达到了传统直升机200倍至400倍以上的水平。而红外、噪音和视觉等方面则只有1.3倍到6倍左右的水平。
如果以在阿富汗和伊拉克的直升机被击落案例而言，几乎所有案例都是在目视距离遭到了肩扛式导弹、中小口径高炮\机枪甚至是RPG的直接射击导致的。科曼奇项目投入了大量精力的雷达隐身优势能发挥多少作用存疑。
科曼奇计划的支持者也承认原本预定的作战环境已经不复存在。但是同时也指出低强度冲突要求美军陆航应该具备更为灵活的部署能力且更少依赖前进基地，而科曼奇项目的航程指标能满足这一点（更远的航程能够进行更远距离的自力飞行部署，而且作战中对前进基地的需求也更少）。可惜科曼奇项目越发失控的重量正在逐步消灭这些优势。
同时，科曼奇项目的支持者还表示，RAH-66+AH-64的组合，在作战效率上要远胜之前OH-58D+AH-64的组合。当然，RAH-66性能超过OH-58D肯定是毫无问题的。但是，即使是支持者也难以说服他人的问题就是为此付出的额外成本对于性能改善而言是否值得：
多次调整采购数量后，RAH-66的采购成本已经达到了3230万美元（以650架采购规模计算）。而同期OH-58D新机的采购价仅为这一数字的五分之一左右。同时，原本宣传的RAH-66后期使用维护成本较低优势是否能达到也存疑。仅就单位时间飞行成本（包含燃料、消耗品和维修费用）而言，RAH-66的数字为1815/2042美元每小时（不装备长弓雷达/装备长弓雷达）。这一数字虽然低于AH-64A和AH-64D 3445/3622美元每小时，但是远高于OH-58D的1598美元每小时。
尽管其维护人力需求MMH/FH（每飞行小时所需维护人-时）由于零部件较少的原因仅有2.81。远低于OH-58D的4.5和AH-64A/D的9.5/8.4。但是这一目标是否过于理想化一直存在争议。
而更大的争议则在于RAH-66和AH-64D之间的角色冲突上。按照最初规划，RHA-66只是用于取代OH-58系列，作为独立的侦察攻击平台以及与AH-64D配合作战的目标指示平台。然而科曼奇项目采购数量的连续大砍使得美国陆军不得不投入大量精力用于改进AH-64机队，以此弥补RAH-66数量减少带来的作战能力缺失。而尴尬之处就在于AH-64机队升级改进的结果越发挤占了科曼奇项目的生存空间。
随着整体预算资源的缩水（尤其是陆军的预算），科曼奇项目挤占了越来越大比例的陆军航空兵经费资源。在多个财年，科曼奇项目的费用占比已经达到了整个陆军航空兵相关预算的40%。如果按照计划，在2008财年正式开始批量采购RAH-66时更将占用陆航三分之二的经费。升级AH-64机队和维持RAH-66研发与采购两个方向的计划间出现了越来越难以调和的预算冲突。
而阿富汗战场和伊拉克战场已经发生了多起美军直升机损失。截止2004年1月底，美国陆军和海军陆战队已经损失或被击伤了累计56架直升机（陆军41架、陆战队15架）。其中不乏2003年11月2日，一架CH-47D被击落导致16死26伤以及2004年1月8日一架UH-60被击落造成9人死亡这样的严重损失。
这些损失引发了严重的公关危机，公关压力导致美国陆军需要尽快对现役机型进行现代化升级以应对新的生存性压力。
在有限的总体的预算限制下，科曼奇项目占用的大量预算成了极其扎眼的存在。而小布什政府此时正在考虑取消多项军用飞机项目的发展计划，空军的F-22和陆战队的V-22都在此列。进度拖延多年且必要性不高的科曼奇项目成了最终唯一被真正取消的项目。
2004年2月23日，美国陆军正式宣布取消科曼奇计划，并向国会建议，以原定在2011年采购121架RAH-66的经费用于增购796架UH-60和其他原有型号直升机。并同时进行1400架现役直升机的升级工作。同年2月26日，科曼奇项目二号原型机进行了最后一次试飞，标志着这一开发时间长达21年，耗资69亿美元的直升机开发项目宣告终结。而2004年初，5架EMD阶段原型机已经在两家承包商的生产线上开始最后的组装。
取消计划后，美国陆军为了补足空缺的侦察直升机需求并为日渐老化的OH-58D机队寻求替代产品。开始了以低成本和短研发周期为主要目的ARH（武装侦察直升机）项目，计划采购368架。
ARH计划以贝尔和波音的两个现有平台改装方案（分别以Bell 407和MD500为基础）进行简单对比后选定了贝尔的方案成为ARH-70。但是最后因为项目超支70%而被取消。
随后以ARH-70搭载的设备简化后安装在OH-58机体上的OH-58F项目最终也无疾而终。2006年，OH-58D退役后，美国陆军现阶段的侦察/攻击任务基本全部交给了AH-64机队，剩余的侦察能力不足部分则由无人机补足。而随后的AH-64E项目中更是重点强化了其无人机控制能力。
不过AH-64毕竟不能完全替代原本由OH-58D执行的任务。为了替代OH-58D退役后的任务能力空白，美国陆军在2017年开始了未来攻击侦察飞机（Future Attack Reconnaissance Aircraft FARA)项目（值得一提的是项目名称中去掉了代表直升机的H，而是更为模糊的Aircraft），旨在提供一型能够执行侦察攻击任务的新型飞行器。要求单价不超过3000万美元，配备20MM机炮和指定的导弹系统，并使用改进版T901发动机。同时要求航速不低于205节，尺寸不超过40英尺。
在从最初8架厂商中筛选出5家进行初步的详细设计后，计划开始在洛克希德·马丁-西科斯基和贝尔间进行最后的对决。美军希望在2021年确定赢家并在2023年进行原型机首飞。
某种意义上，这又是一轮循环。
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