《英雄传说 空之轨迹FC》是“空之轨迹”系列的第一部，也是史上最庞大日式RPG系列之一的“轨迹”系列的开端。
随着神秘的“导力技术”问世，社会步入了现代化的进程。50年前，这项技术的发明为整个大陆带来了一场“导力革命”。由此发展而来的“导力器”让人类文明飞速发展，新奇的创新发明层出不穷——其中值得一提的就是空艇，也就是“飞行船”工业。尽管这场革命的积极影响显而易见，但是别忘了，事物都会有两面性；所有器械都开始采用这些技术开发，就连高级的武器和军火也不例外。就这样，整个大陆至今仍一直处于动荡之中。
在利贝尔王国洛连特长大的少女艾丝蒂尔，自幼向往成为一名游击士。她和父亲收养的男孩约修亚以成为正游击士为目标，一起走访王国各地自我修行与解决各式各样的委托。
两人在旅途中与众多的人们建立起了羁绊，最终也与众人也解决了利贝尔王国的大事件；然而，约修亚却在最后向艾丝蒂尔坦白了令人惊愕的事实……